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• 6월 2주차 Traditional statistical methods often out-perform machine learning methods for time-series forecasts | LinkedIn All about Python — 100 + Code Snippets, Tricks, Concepts and Important Modules | by Senthil E | Towards Data Science All about Python — 100 + Code Snippets, Tricks, Concepts and Important Modules Python is the most popular language as of now. It is used heavily in all fields from websi.. Resources/Weekly reading list 2022. 6. 7.

• 5월 5주차 ; 6월 1주차 Explainable AI: Unfold the Blackbox | by Charu Makhijani | May, 2022 | Towards Data Science Explainable AI: Unfold the Blackbox Build trust in machine learning with XAI, Guide to SHAP & SHapley Values towardsdatascience.com How to add explainability to your machine learning project | by Othmane Jebbari | Margo Analytics | May, 2022 | Medium How to add explainability to your machine learning proj.. Resources/Weekly reading list 2022. 6. 7.

• 6월 2주차 automated multi-modal graph-based pipeline for mouse genetic discovery | Bioinformatics | Oxford Academic (oup.com) Statistical and Machine Learning forecasting methods: Concerns and ways forward | PLOS ONE Structural basis of GABA reuptake inhibition | Nature Structure of cytoplasmic ring of nuclear pore complex by integrative cryo-EM and AlphaFold (science.org) Challenges and potential solutio.. 이번 주 논문들 2022. 6. 7.

• [Apple Silicon] M1 mac 에서 PyTorch 설치 1. miniforge 설치 # By brew brew install mimiforge # Or install by wget wget https://github.com/conda-forge/miniforge/releases/latest/download/Miniforge3-MacOSX-arm64.sh bash Miniforge3-MacOSX-arm64.sh rm https://github.com/conda-forge/miniforge/releases/latest/download/Miniforge3-MacOSX-arm64.sh # Cleanup. 2. conda 환경생성 & torch 설치 # Create env conda create -n pytorch conda activate pytorch conda .. 개발 2022. 6. 4.

• 5월 5주차 ; 6월 1주차 ColabFold: making protein folding accessible to all | Nature Methods Mapping the developing human immune system across organs (science.org) DIRECT-NET: An efficient method to discover cis-regulatory elements and construct regulatory networks from single-cell multiomics data (science.org) A systems biology approach identifies candidate drugs to reduce mortality in severely ill patients with COVID.. 이번 주 논문들 2022. 6. 3.

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  People construct simplified mental representations to plan People construct simplified mental representations to plan | Nature * Open Access 가 아니라서 Abstract 만 인간의 인지능력 중 가장 특이한 요소는 계획을 하는 능력 이다. 인간의 계획능은 두가지 측면이 있는데, 효율성과 유연성이 그것이다. 효율성은, 사람들은 복잡한 환경속에서 일정이 존재할지라도 제한된 인지 자원 을 이용해서 매일의 계획에 대한 답을 찾는다는 접에서 특히 인상적이다. 심리학, 경제학, 인공지능은 인간 계획의 성공은 사람들이 어떠한 일에 대한 완전한 표현(task representation)을 가지고 있고, 경험적인 것을 기반으로 해서 미래에 대한 계획을 세운다고 설명한다. 하지만, 이런 접근은 일반적으로 task r.. 논문 리뷰/Abstract only 2022. 5. 29.

• [4] Python list comprehension 써보기. 파이썬에서 리스트 안에 리스트가 있는, "Nested list" 일 때, flatten ( nested list 를 하나의 리스트로 통합하는 ) 을 하는 좋은 방법을 소개한다. 1) List comprehension netsted_list = [[1, 2], [3, 4], ["a", "b"]] new_list = [item for nested_list_sub in nested_list for item in nested_list_sub] print(new_list) # output [1, 2, 3, 4, 'a', 'b'] 리스트(nested_list) 안에 리스트(nested_list_sub)를 하나씩 가지고 와서(item), 새로운 리스트(new_list) 로 받아서 저장해주는 방법이다. List com.. 데이터/Data Manipulation 2022. 5. 29.

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  A natural mutator allele shapes mutation spectrum variation in mice A natural mutator allele shapes mutation spectrum variation in mice | Nature 2022, Nature Jonathan K. Pritchard & Kelley Harris groups * Open Aceess 가 아니라서 Abstract만 Germline mutation rate 은 종마다 비율도 틀리고 양상도 틀리지만, 돌연변이율에 대한 유전적 공통 modifier 는 아직 밝혀진바가 없다. 이 논문에서는, panel of recombinant inbred mouse lines known as the BXD 를 사용하여 germline mutagenesis 에 영향을 미치는 loci를 찾으려고 했다. 각각의 BXD lineage 는 Brother.. 논문 리뷰/Abstract only 2022. 5. 29.

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  The genomic origins of the world’s first farmers The genomic origins of the world’s first farmers: Cell 2022, Cell Excoffier group HG : Hunter-gatherer LGM : Last glacial maximum ( 후기 최대 빙하기 ) EF : European farmer Admixture : 고립되어있던 genetic lineage 가 섞이는 것. 유럽과 서남아시아 Neolithic farming population의 정확한 유전적 기원, 분화된 시간대 등은 대개 알려져 있지 않다. High-quality 고대 genome 의 demogenomic 분석을 통해 Anatolia 와 유럽의 초기 농부들이 서남아시아 인구의 Multiphase mixing 과 더불어 LGM 이후 bott.. 논문 리뷰/Other topics 2022. 5. 29.

• [3] Pandas transform : lambda 대신 데이터프레임에 사용가능, 하지만 더 다양하게. When to use Pandas transform() function | by B. Chen | Towards Data Science When to use Pandas transform() function Some of the most useful Pandas tricks towardsdatascience.com 데이터/Data Manipulation 2022. 5. 29.

• [2] Pandas cut : 조건식 있는 loc 대신 쓸 수 있는 방법. bins=[0, 12, 19, 61, 100] labels=[' 데이터/Data Manipulation 2022. 5. 29.

• 5월 4주차 reading list Monkeying with DALL-E. Generative Art Storytelling | by Harsha Angeri | May, 2022 | Towards Data Science Monkeying with Dall-E Generative Art Storytelling towardsdatascience.com MLOps in 10 Minutes. How MLOps helps across all stages of ML… | by Alexey Grigorev | May, 2022 | Towards Data Science MLOps in 10 Minutes How MLOps helps across all stages of ML project towardsdatascience.com Understand .. Resources/Weekly reading list 2022. 5. 27.