논문 리뷰/Other topics

The genomic origins of the world’s first farmers

Cho et al. 2022. 5. 29.

The genomic origins of the world’s first farmers: Cell

 

2022, Cell

Excoffier group

Original figure from paper

 

HG : Hunter-gatherer

LGM : Last glacial maximum ( 후기 최대 빙하기 )

EF : European farmer

Admixture : 고립되어있던 genetic lineage 가 섞이는 것. 

 

 

유럽과 서남아시아 Neolithic farming population의 정확한 유전적 기원, 분화된 시간대 등은 대개 알려져 있지 않다. High-quality 고대 genome 의 demogenomic 분석을 통해 Anatolia 와 유럽의 초기 농부들이 서남아시아 인구의 Multiphase mixing 과 더불어 LGM 이후 bottleneck 으로 인해서 생겨났다는 것을 밝혀내었다. 더 나아가서, 유럽과 anatolia 초기 농부들의 조상이 westward range expansion 중에 극심한 유전적 부동의 시기를 겪었고, 그로 인해서 뚜렷한 유전적 구분성을 가지게 되었다는 것을 보인다. 

 

Original figure from paper
Original figure from paper

B) Admixture coefficient 가 HG, EFs 에서 차이가 큰 것으로 보이고, 

D) Runs of homozygosity 인데, 이는 각 부모로부터 유전된 부분 중 identical haplotype 을 가지는 Genomic region 을 뜻함. 보통 ROH typically 2–40 cM in length 의 길이를 가진다고 함. 이것이 높다는 것은, 그만큼 그 Population 안에서 variation 이 적다는 뜻인듯. 

 

Original figure from paper

 

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