Resources/Personal Projects16

• [UniProt Challenge] Key words sequence alignment, sequence-profile alignment, profile-profile alignment, phylogeny, sequence properties, physicochemical properties, predicted properties, protein interactions, gene expression, mass spectrometry, genetic interactions, protein structure, literature, genomic context, synteny, structure alignment, comparative model, predicted protein structure, denovo prediction, machine learning.. Resources/Personal Projects 2022. 7. 10.

• [UniProt Challenge] Reference 1. Protein - LBS prediction tools Exploring the computational methods for protein-ligand binding site prediction - ScienceDirect Exploring the computational methods for protein-ligand binding site prediction Proteins participate in various essential processes in vivo via interactions with other molecules. Identifying the residues participating in these int… www.sciencedirect.com 2. Protein model.. Resources/Personal Projects 2022. 7. 6.

• [UniProt Challenge] 1. Kick-off meeting 7/1 에 킥오프 미팅이 있었다. 줌으로 진행했고, 영국시간으로 진행해서 나는 녹화본으로 진행했다. Resources/Personal Projects 2022. 7. 4.

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  [UniProt Challenge] 0. Start 올해 초였던가, EMBL 페이지를 보다가 UniProt Metal Binding Site Challenge 를 한다는 말을 들어서 신청했었다. 될까? 라는 생각으로 신청을 했는데, 약 5개월 후인 어제 kick-off meeting 이 7월 1일로 정해졌다며 메일이 왔다. 구글 문서로 motivation, goal, data 등을 제공 받았고, 7월 1일부터 스타트해서 연말까지 성능을 제출하는 것이 Round 1 이다. EMBL Uniprot metal binding site prediction challenge 는 총 2 round 로 진행이 되는데, Round 1 : 전체적인 성능 제출, 모델 비교 후 최상위 성능의 프로그램을 고르고, Round 2 : Round 1 에서 뽑힌 프로그램을 튜닝 / 저.. Resources/Personal Projects 2022. 6. 28.