APOBEC mutagenesis is a common process in normal human small intestine

APOBEC mutagenesis is a common process in normal human small intestine | Nature Genetics

2023, Nature genetics

Simon James Alexander Buczacki & Michael R. Stratton

 

APOBEC Mutational signature SBS2와 SBS13은 많은 인간 암 유형에서 일반적임

하지만 정상 세포에서 암 세포로의 진행될 때 만약 APOBEC 효소가 관여되어 있는 경우라면 조금 다른 이야기가 될 수도 있음. 

여기서 우리는 39명의 소장에서 342개의 미세하게 분리된 정상 Crypt cell 을 WGS 했고 SBS2/SBS13 돌연변이가 대부분의 다른 정상 조직보다 더 빈번하게 17%의 Crypt cell 에 존재한다는 것을 발견

SBS2/SBS13이 있는 crypt cell은 종종 SBS2/SBS13이 없는 즉각적인 crypt-인접 네트워크를 가지고 있으며, 이는 SBS2/SBS13의 근본적인 원인이 세포 자체 유래임을 시사함

APOBEC 돌연변이는 어린 아이들을 포함하여 인간의 수명 전반에 걸쳐 일시적인 방식으로 발생했음

APOBEC1 mRNA 수치는 소장 상피에서는 매우 높았지만 대장 상피와 다른 조직에서는 낮았음

그 결과 소장에서 SBS2/SBS13의 높은 수치는 APOB mRNA를 편집하는 생리적 기능을 수행하는 APOBEC1의 부수적인 손상임을 시사함