IGV 로 read 들을 보는 것은 꽤 많은 노력이 들어가는 일 인데, 쉽게 할 수 있는 것들을 찾아서 적어본다.
나도 예전에 batch script 를 사용한 자동화를 한 적이 있는데, 그 과정보다 훨씬 편해 보인다.
Igv | Dash for Python Documentation | Plotly
Igv | Dash for Python Documentation | Plotly
dash_bio.Igv Examples and Reference see Igv in action. Igv An example of a default Igv component without any extra properties. Select the genome to display below. import dash from dash.dependencies import Input, Output import dash_bio as dashbio from dash
dash.plotly.com
igv_plotter
python interface to IGV that simplifies creating screenshots of BAMs, VCFs, BEDs, etc for one-off spot checking or automated / scripted image collection
pypi.org
GitHub - stevekm/IGV-snapshot-automator: Script to automatically create and run IGV snapshot batchscripts
Script to automatically create and run IGV snapshot batchscripts - GitHub - stevekm/IGV-snapshot-automator: Script to automatically create and run IGV snapshot batchscripts
github.com
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